SNP (single nucleotide polymorphism, o polimorfismo de un solo nucleótido) es una variación en la secuencia de DNA, codificante o no codificante, que involucra un solo nucleótido (A, T, C, or G) en el genoma y que difiere entre individuos o entre las dos copias del gen presente en el par de cromosomas de un mismo individuo.
Por ejemplo, si en cierta posición de un gen puedes tener el nucleótido G o el C indistintamente, una puede tener G-G si tiene las dos copias del gen iguales, o puede tener C-C, o G-C; es diferente entre individuos.
Se suelen identificar con un nombre alfanumérico arbitrario y no siempre tienen un efecto neutro.